Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CALCOCO2Q13137 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CALCOCO2Q13137 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms