Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DUSP4Q13115 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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