Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHAF1AQ13111 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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