Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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IFT88Q13099 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IFT88Q13099 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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