Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SMARCB1Q12824 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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