Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ARID5AQ03989 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms