Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP2C1P98194 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP2C1P98194 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms