Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LMO4P61968 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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