Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGA8P53708 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms