Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GATMP50440 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GATMP50440 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GATMP50440 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms