Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LINC00648-204ENST00000557749 443 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSEN1P49768 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms