Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GRIA4P48058 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GRIA4P48058 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms