Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FDFT1P37268 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FDFT1P37268 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FDFT1P37268 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FDFT1P37268 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms