Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASP1P29466 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms