Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PLNP26678 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
PLNP26678 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms