Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PTAFRP25105 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms