Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPREP23469 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPREP23469 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPREP23469 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPREP23469 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPREP23469 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPREP23469 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPREP23469 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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