Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms