Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NELFEP18615 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NELFEP18615 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NELFEP18615 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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