Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATP2A2P16615 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms