Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TIMP1P01033 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms