Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SKAP2O75563 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms