Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC9O60706 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms