Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPAG9O60271 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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