Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 CPPED1-202ENST00000381774 6273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 DPY19L1-201ENST00000310974 4870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SLC25A20O43772 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms