Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HHLA1C9JL84 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HHLA1C9JL84 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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