Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CLDN25C9JDP6 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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