Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MTMR11A4FU01 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms