Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VWA8A3KMH1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms