Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SH3BP1Q9Y3L3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SH3BP1Q9Y3L3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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