Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRG3Q9Y2Y8 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms