Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RRBP1Q9P2E9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms