Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC10Q9NYD6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms