Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLHL11Q9NVR0 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms