Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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PFDN4Q9NQP4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PFDN4Q9NQP4 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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