Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FANCFQ9NPI8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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