Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRDM12Q9H4Q4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRDM12Q9H4Q4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms