Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF646-201ENST00000300850 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM12-202ENST00000374104 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms