Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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LINC00526Q96FQ7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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LINC00526Q96FQ7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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