Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRT35Q92764 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms