Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMYD4Q8IYR2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms