Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC117Q8IWD4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms