Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HERC6Q8IVU3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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