Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VITQ6UXI7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VITQ6UXI7 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms