Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA3Q53S33 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms