Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms