Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NEK6-212ENST00000539416 2582 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXJ3-202ENST00000361776 5106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPN8-201ENST00000366872 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ERBB2-204ENST00000541774 4341 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TRMT112-205ENST00000539854 659 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CYP4F3-206ENST00000591058 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSM5-201ENST00000331849 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 GEMIN4-207ENST00000576778 4729 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TLE4-201ENST00000265284 2382 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE6B-201ENST00000255622 3280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP25-1Q3LHN0 NEXMIF-201ENST00000055682 11719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms