Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TWISTNBQ3B726 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms