Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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