Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HADHQ16836 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HADHQ16836 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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